Yatırım Teşvik ile ilgili 9 seri nolu Gümrük Genel tebliğinde değişiklik yapılmasına dair 11 seri nolu tebliğ 12 Mayıs 2012 tarihli 28290 sayılı Resmi Gazetede yayımlanmıştır. Yapılan değişikliklerden öne çıkan başlıklar aşağıda yer almaktadır.

Tebliğin 9 uncu maddesinin üçüncü ve dördüncü fıkraları aşağıdaki şekilde değiştirilmiştir:

"(3) Baskı, basım, matbaa, tekstil, hazır giyim, konfeksiyon ve vinç hizmetleri yatırımlarına yönelik teşvik belgeleri kapsamında kullanılmış makine ve teçhizat ithal edilemez.

(4) Kullanılmış olarak ithal edilen makine ve teçhizatın amacı dışında kullanılması veya 10 uncu madde hükmü saklı kalmak üzere satılması halinde, sağlanan destek unsurları ilgili mevzuat çerçevesinde geri alınır. Söz konusu makine ve teçhizat, kullanılmış komple tesis kapsamında temin edilmiş ise 4 ay içerisinde ihraç edilir veya gümrüklerce yapılacak tüm masraflar yatırımcı tarafından karşılanmak suretiyle tasfiye edilmek üzere gümrüklere terk edilir."

Tebliğin 12 nci maddesi aşağıdaki şekilde değiştirilmiştir:

" (1) Ekonomi Bakanlığı tarafından herhangi bir nedenle;

a) Teşvik belgesinin iptal edilmesi durumunda, iptale ilişkin karar mezkûr Bakanlık tarafından Resmî Gazete'de yayımlanır. Gümrük müdürlüklerinin işlemlerin takibine ilişkin sorumlulukları yayım tarihinde başlar ve iptal kararları düzenli olarak takip edilerek üçüncü fıkra uyarınca işlemler tamamlanır.

b) Belge iptal edilmeden makine ve teçhizatın belge kapsamından çıkartılması durumunda, Ekonomi Bakanlığınca çıkartılma nedeni ve herhangi bir yaptırım uygulanıp uygulanmayacağı hususu Bakanlığa (Gümrükler Genel Müdürlüğü) bildirilir. Söz konusu makine ve teçhizata sağlanan destek unsurları 6183 sayılı Amme Alacaklarının Tahsil Usulü Hakkında Kanun çerçevesinde geri alınır.

(2) Yatırım teşvik belgesi kapsamında ithal edilen makine ve teçhizata ait istisna uygulanmış katma değer vergisi, teşvik belgesinin iptal edilmesi veya makine ve teçhizatın teşvik belgesi kapsamından çıkarılması nedeniyle tahsil edilirken, 3065 sayılı Katma Değer Vergisi Kanununun 13 üncü maddesinin birinci fıkrasının (d) bendi uyarınca alınması gereken gecikme faizi 6183 sayılı Amme Alacaklarının Tahsil Usulü Hakkında Kanun çerçevesinde uygulanır.

(3) Ekonomi Bakanlığı tarafından herhangi bir nedenle teşvik belgesinin iptal edilmesi halinde gümrük idarelerince;

a) İptal edilen yatırım teşvik belgesine istinaden Ekonomi Bakanlığınca onaylanan makine ve teçhizat listesi kapsamında gümrüklerinden yapılan ithalat işlemleri tespit edilerek, sağlanan destek unsurları 6183 sayılı Amme Alacaklarının Tahsil Usulü Hakkında Kanun çerçevesinde geri alınır.

b) İthalat için müracaatta bulunulması durumunda muafiyet uygulanmaz."

Tebliğin 13 üncü maddesinin ikinci fıkrasının (a) bendinde ve dördüncü fıkrasında geçen "%30'a kadar (30 dahil)" ibareleri "%50'ye kadar (50 dahil)", ikinci fıkrasının (b) bendinde geçen "%30'un" ibaresi "%50'nin" ile beşinci fıkrasının (b) bendinde geçen "%30 oran içerisinde (30 dahil)" ibaresi "%50 oran içerisinde (50 dahil)" şeklinde değiştirilmiştir.

Tebliğin 16 ncımaddesinin ikinci fıkrasının (a) bendinde geçen "%30'a kadar (30 dahil)" ibaresi "%50'ye kadar (50 dahil)", ikinci fıkrasının (b) ve (c) bentlerinde geçen "%30'u" ibareleri "%50'yi" ile üçüncü fıkrasının (b) bendinde geçen "%30 limiti içinde (30 dahil)" ibaresi  "%50 limiti içinde (50 dahil)" şeklinde değiştirilmiştir.

Söz konusu değişiklikler tebliğin (12 Mayıs 2012) yayımı tarihinde yürürlüğe girmiştir.